Ti da null perché stai cercando di leggere la lungezza di un id che essendo un id deve essere univo, se vuoi sapere quanti checkbox nell'iframe ci sono vedi leggere il tag input con un ciclo for e poi verificare il type, oppure non ho capito cosa vuoi fare.


P.S. le checkbox dovrebbero essere un array non mi risulta da quello che so io l'unico oggetto form considerato collezioneo/array sono i radio, ma non sono sicuro.