La linea di codice la devi modificare così:

Codice PHP:
echo"<td height='23' class='Pulsante'>[img]ico/table_save.png[/img][url='index.php?nomefile=$file']Cancella $file[/url]</td>
          </tr>"; 
In index.php tramite GET recuperi il nome del file che è stato cliccato, e poi esegui la cancellazione attraverso uno script.

Queste sono le basi.

Ti consiglio di andare a leggerti questo link.