come no??

il check del disco non c'entra con la formattazione.

ovvio che devi avere un live cd windows (o mi pare con il cd di ripristino di win, vai sul promt e dai chkdisk) o con una distro linux..
il tuo obbiettivo è fare un check del disco.

se trova qualcosa prova a risolvertelo, e se lo risolve puoi provare a formattare (sempre tramite livecd oppure tramite l'installazione di windows in NTFS). e poi installi.

se invece il check del disco fallisce ho paura che il disco potrebbe essere danneggiato..