ora non mi è chiaro il perchè del casino del richiamare sempre lo stesso file, e non indago. ma il concetto è abbastanza semplice

se nello script iniziale hai

$miavar = 1
allora ti basta inserire nello script che richiami

$miavar++;

in questo modo la variabile globale si incrementa ad ogni chiamata di file(e quindi di riga)


leggo ora che usi ajax

quando fai la chiamta passagli il valore attuale della variabile in modo che la puoi calcolare