Come prima operazione, entra nella partizione funzionante e imposta uno scandisk approfondito sulla partizione che non va: siccome condividono tutto, l'unico sospetto in tema hardware è che sia danneggiata la parte di hard disk dove risiede la partizione che si blocca.
Dalla partizione funzionante: Risorse del computer, clic destro sull'icona dell'altra partizione, Proprietà, Strumenti, Esegui Scandisk, seleziona le due opzioni e Avvia. Potrebbe chiederti di riavviare il pc, fallo.

Per le cause di tipo software, sospetterei un virus, ergo suggerisco scansione della partizione "malata" avviandola da quella "sana", ma in tal caso la questione è da inoltrare e trattare nella sezione Sicurezza informatica, quindi vediamo prima che dice lo Scandisk.