La backdoor è una porticina sul retro letteralmente, un accesso aperto sulla tua macchina da software malevolo che ne permette l'accesso dall'esterno ai malintenzionati. Il rootkit è codice maligno che permette di acquisire privilegi di root su una macchina Unix. Ad ogni modo i tuoi problemi li vedo più come malfunzionamenti dovuti a qualche baco piuttosto che come attacchi deliberati.