Non sono sicuro di aver capito cosa vuoi esattamente... ma per la parte che riguarda la correlazione tra i siti il giusto metodo sarebbe avere le classi a disposizione su un server di riferimento e quindi probabilmente (che è anche la soluzione più semplice) ospitare tutti i siti sullo stesso server.

Poi a un certo punto dici "non sarebbe stato un ottimo metodo", ma cosa? Se parli del "concetto" di richiamare uno script di definizione "centralizzato", questo andrebbe bene... piuttosto non potresti comunque fare come pensavi perchè il codice PHP tramite il protocollo HTTP verrebbe interpretato e non "incluso" come vorresti. Se i siti fossero sullo stesso server potresti accedere a una cartella "comune" o comunque leggere le cartelle degli altri siti.