Per quello che lo uso non mi sta dando problemi xdebug anche se non è da molto che lo sto usando.
All'inizio ho però fatto molti test con Zend debugger e Xdebug per capire quale usare e alla fine mi è sembrato più semplice utilizzare xdebug.
Sto usando Xp sp3, Apache 2.2 e php 5.2.10
Come ide di sviluppo e debug sto usando Netbeans.
P.S
Andando un po fuori ot, con eclipse come ti trovi?...io ho provat aptana su eclipse oppure eclipse pdt, ma non mi convince in particolare il fatto che non si riesce ad avere php+javascript con l'intellisense nella stessa pagina.