No, queste finestre si aprono tutte dalla stessa pagina, che è un frame centrale. Poi c'è anche un frame laterale che con i vari link di navigazione, ma credo che questo non dovrebbe dar fastidio.
Mi chiedo se non si possa creare uno script che dirà al browser "Apri una nuova finestra, ma se ce n'è un'altra già aperta, chiudi quest'ultima".
Lo so, a parole sembra facilissimo...
Ho provato a vedere sul web ed ho intuito che potrebbe funzionare qualcosa con i comandi window.open, window.close, window.opener.close, window.onload, ecc.
Solo che come ti dicevo per me il javascript è turco!!