Non tutto il Javascript. Solo i dati, qualcosa come

codice:
<%
    String[] data={"hello", "world"};

    String jsData="[";
    for (int i=0; i<data.length; i++)
    {
        jsData=jsData+"'"+data[i]+"'";
        if (i<data.length-1) jsData=jsData+", ";
    }
    jsData=jsData+"]";
%>

<script>
var array=new Array(<%=jsData%>);
</script>