Per il multidominio mi appoggio sempre a pannelli di controllo diversi da webmin, nel tuo caso penso sia più opportuno effettuare una installazione o reinstallazione completa per poi configurare con un pannello di gestione multidominio anche più agevole da gestire per chi non è molto ferrato, altrimenti l'alternativa è rimboccarsi le maniche e leggere molta documentazione.
In ogni caso hai un pm.