Sebbene alcuni motori di ricerca indicizzino i contenuti dinamici generati da Javascript
Se tra i motori di ricerca che prendon in considerazione una serie di link inseriti tranite inclusione javascript c'è anche GOOGLE a me basta.

Tornare al php (forse la soluzione piu semplice) mi porta i 2 limiti soliti:
a. server che abbia php installato
b. pagine che non siano .html

Come potrai immaginare non sono requisiti facilissimi da soddisfare.

Cosa mi consiglieresti?