Apri un paio di shell e dai:
tail -f /var/log/messages
tail -f /var/log/syslog
Monta quindi la CF. Vedi se le informazioni stampate ti possono esser d'aiuto.
Per parte mia, io utilizzo un CARD READER USB all in 1 per evitare problemi.
P.S.: navigando il link che hai fornito, vedo che il PC ha già Ubuntu installato, quindi molto probabilmente ( = sicuramente) i driver per il corretto funzionamento ci sono.
Prova innanzitutto quanto ho scritto sopra.