Salve ho risolto il problema, posto la soluzione in caso possa essere utile a qualcuno

editare il file menu.lst

codice:
sudo gedit /boot/grub/menu.lst
e modificare il vecchio kernel 2.6.28-15 della ubuntu 9.04 con quello nuovo 2.6.31-14, riavviare e al riavvio mousepad e audio funzionano!