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In qualunque manuale trovi cos'e' e come si usa il metodo setTimeout(), io il consiglio te l'ho dato, stava a te adattarlo alla tua situazione reale, posso provare a darti la pappa pronta:

document.getElementById("bottone").disabled=true;
var win= window.open('pausa.html','f','width=200,height=200');
setTimeout("nulla();", 60000);

function nulla() {
  win.close();
  document.getElementById("bottone").disabled=false;
}

ma, ripeto, dipende dalla tua situazione reale.

ciao