Grazie per aver risposto. Ho messo questi due valori nel codice:

param name="wmode" value="transparent"
e nell'embed wmode="transparent"

e poi ho inserito <div style="z-index: 15000"> Contenuto in flash </div>

Ecco qui il link per vederne il risultato.. magari ho sbagliato qualcosa nel codice?

http://vado.li/test