1 - scaricati il driver JDBC per mysql qui http://dev.mysql.com/downloads/connector/j/5.1.html e metti il jar nel tuo classpath

2 - apri una connessione così
codice:
Class.forName("com.mysql.jdbc.Driver");
String url = "jdbc:mysql://nomehost:3306/nomedatabase";
Connection connection = DriverManager.getConnection(url,"nomeutente", "password");
3 - non sò come funziona il generatore che hai usato ma DAOFactory avrà qualcosa che ti ritorna un UtenteDAO, NON instanziare UtenteDAOImpl direttamente

4 - usa i metodi dell' UtenteDAO passandogli la connessione che hai creato

5 - ricordati di chiudere la connessione quando hai finito, in genere si fà tutto dentro un "try" e chiudi la connessione nel "finally"