mmmh strano..
sul portatile ho ubuntu da 2 anni e smart mi dice che l'HD è ancora in buone condizioni...
prova a vedere cosa dice smart da una live che lo contiene
cmq nella 9.04 cera effettivamente un bug che in casi particolari accorciava la vita degli HD
http://forum.ubuntu-it.org/index.php?topic=132572.0
ma solo nel caso si attivasse manualmente il laptop mode...