In risposta alla prima domanda, se non mi sbaglio pubblicano solo roba con la GPL, quindi puoi usarli sia a livello commerciale che privato, ma se modifichi lo script devi pubblicare le modifiche da qualche parte.

Comunque, ti consiglio sempre, quando scarichi uno script, di cercare il sito originale, li ci trovi di sicuro della documentazione che spiega come usarlo al meglio.

In questo caso: http://www.outcut.de/MooFlow/Documentation.html

Il colore di sfondo lo setti con una option da passare al costruttore dell'oggetto MooFlow