La conversione da doc a pdf avviene mediante una stampante virtuale se usi Word. Se vai in Pannello di controllo, Stampanti, oltre alla stampante "fisica" dovresti trovare anche quella virtuale, molto probabilmente con "pdf" nel suo nome...

Per automatizzarla, prova ad andare su Strumenti, Opzioni, Stampa e modificare lo stato "Stampa in background"...