Certo che ne esistono, lo stesso Clamav è nato sotto linux e poi adattato anche su win.
Su Ubuntu basta che dall'Ubuntu Software Center installi "Virus scanner" che troverai negli Strumenti di Sistema; è un programma che installa clam ed un'interfaccia grafica per la scansione.
Non farai altro che lanciare quel programma, mettere gli spunti su tutte le caselle che ci sono ed infine selezionare il dispositivo / cartella / file da scansionare, facendo così partire il controllo.
Un altro ottimo programma per la scansione è Klamav, che trovi sempre nel Software Center.