Ok, credo che l'utilizzo di <base/> sia la scelta migliore...
Nel mio caso, avendo due sottositi, dovrò impostare due base differenti, uno che punta sulla root del sito1 e l'altra su quella del sito2...
Sto provando ora in dreamweaver ad impostare la cartella predefinita, ma mi chiede un indirizzo http per cui devo dargli quello del server definitivo, giusto?
Mentre nei file locali mi come href mi chiede di puntarlo su di un file, ho pensato al file home della directoy principale del sito2, è ok???