Dovresti usare la sintassi giusta, questo sembra piu' vbscript...
codice:
var v = new Array();
for (var i=1;i<=4;i++) { v[i] = new Array() }

function reset(){ 
	var c=1; 
	for(var i=1; i<=4; i++){ 
		for(var j=1; j<=4; j++){ 
			v[i][j] = c; 
//			alert(i+" "+j+" "+c+" "+v[i][j])
			c = c + 1; 
		}		 
	} 
} 

function controlla(){ 
	alert(v[1][1])
}
ciao