Allora, a #pagina hai dato una altezza fissata in 700px, quindi di certo #naviga e #corpo non potranno mai occupare tutta la pagina: non glielo permette il fatto che il loro contenitore abbia una altezza fissata!

Quindi: dai a #pagina (che a questo punto io chiamerei piuttosto #sfondo!)
height:100%;
position:absolute;
z-index:-1;

elimina del tutto #corpo che non serve assolutamente a nulla e lascia #apDiv1 così com'è e dovresti essere a posto.

Ciao!