Figurati.

Non ho esperienza significativa con MODx, per cui non posso darti dei suggerimenti su come personalizzare il menu. Dando uno sguardo alla documentazione, esso viene generato dinamicamente a seconda della struttura gerarchica del contenuto (e quindi della pagine inserite) tramite uno 'snippet' chiamato Wayfinder: http://wiki.modxcms.com/index.php/Wayfinder

Curiosità: perché hai scelto proprio MODx?