Di solito quelle cose si fanno dalla webmail, in modo che l'impostazione venga fatta direttamente sul server, cosi' appena arriva l'email il server manda la risposta col messaggio di ferie.
La mia azienda usa kerio mail server, e quell'opzione ce l'abbiamo nella webmail.
Tuttavia ti ho trovato questo, guarda che bravohttp://tbirdhowto.wordpress.com/category/auto-reply/