bisognerebbe capire cosa devi fare..

comunque selezioni le figure e da elaborazione tracciati "sotto meno sopra"
le hai selezionate entrambe?

cosi' ottieni la trasparenza ..
se salvi come gif per esempio e vuoi salvare mantenendo la trasparenza cosi' va bene.

ho letto che hai utilizzato la penna per le figure geometriche..non potresti utilizzare direttamente il rettangolo con angoli arrontondati o comunque lo strumento figure geometriche ?