Prova cosi, ma ho forti dubbi:
questo codice lo inserisci nella <head></head> della pagina che carica l'iframe e la richiamerai come popup window.open() altrimenti non potrai chiuderla.
codice:
<script>
onload=function(){if(document.getElementById('id-Iframe').src != "nomesito.xxx/nomepaginagrafico.xxxx")self.close();
}
</script>
e nel iframe inserirai un id univoco