Se è un hard disk esterno di grosse dimensioni e molto pieno, direi che è abbastanza ragionevole che non sia una periferica pronta all'istante... Idem se è una grossa pendrive che si alimenta dallo stesso alimentatore del pc...

Se si verificasse spesso, suggerirei di disinstallare tutte le porte USB (dal pannello di controllo, sistema, hardware, gestione periferiche) e riavviare affinché vengano riconosciute daccapo... forse hai fatto un upgrade di service pack e le porte usb sono rimaste un po' "indietro"...