io farei una cosa rozza ma efficace.
Perdonami la mancanza di finezza ma non sono così addentrato in materia. Però penso ti possa risolvere il problema.

Supponiamo che tu abbia tre siti. I tre siti stanno in "cartella1", "cartella2", "cartella3".
Le 3 cartelle stanno tutte nella cartella "WWW"

Setti apache in modo da avviare sempre un file index.php contenuto in "WWW".

Nel file index.php scrivi

<html>
<head><title>Scegli il sito</title></head>
<body>
Apri il sito 1
Apri il sito 2
Apri il sito 3
</body>
</html>

In pratica di volta in volta clicchi il sito che vuoi visionare.

E' ovvio che se i siti sono 1000 dovresti aggiungere del codice che ti generi 1000 collegamenti perchè farlo a mano è sconveniente.
Spero nella mia ignoranza di averti dato una mano.