Automatizzare la cosa? ma guarda che il file da scaricare differisce da Browser e Sistema Operativo, non puoi mica mettere in download un file e basta, inoltre è necessario installarlo, cosa che richiede conferma, oltre che chiudere il browser. E poi se esce una nuova versione devi riaggiornare lo script, insomma è un bel casino. La cosa migliore è mettere un link a http://get.adobe.com/it/flashplayer/