ma lo fai dal filemanager o da "cp" ?
nei parametri di cp non c'e'
p.s.
ma hai fatto un fsck per segnare i blocchi corrotti?
fsck -c /dev/....
p.s.
oppure usare cpio
http://www.computerhope.com/unix/ucpio.htm
con l'opzione -k ( Attempt to skip corrupted file)