In querystring puoi inviare stringhe non elementi del form, nel tuo caso dovrai inviare un parametro e in base a quello popolare la select (con il DOM http://javascript.html.it) oppure invii alla url della pagina madre il parametro (location.href='miapaginamadre.xxx?valorepopup=xxx ') e ricarichi la stessa che eseguirà un query che popolerà la select.
Difficile da spiegare.