Volevo comunicare che ho risolto da solo, semplicemente il problema era dovuto all'assembly dei due programmi che non era lo stesso, o meglio, ad alcune impostazioni del formatter che sebbene vengano impostate non sortiscono alcun effetto (http://connect.microsoft.com/VisualS...to-deserialize)
Mi è bastato inserire la classe in una dll e ho risolto
Grazie comunque a chi ha letto il 3d.