Inizia a togliere Flash e usare solo codice html/css è inutile per un menù come il tuo avere cinque file swf, tanto varrebbe usare un intero sito in flash a questo punto.
L'imressione che si ha è di entrare nel sito di un principiante, il mio consiglio personale è di togliere lo sfondo arancio e mettere qualcosa di più simile al box centrale, magari un grigetto tenue e di separare il tutto o da un bordo in rilievo o anche da nulla, si facileterebbe la lettura, ora l'occhio viene attirato dal bordo e non dal contesto, inoltre contrasta ferocemente con i disegni dei tasti che sono più sbiaditi.
Per la questione email, il problema è nel modo di creare il layout, ti appoggi a div ma usa un foglio di stile generale invece di usare elementi introdotti in linea, ti sarà anche più semplice manutenere il codice, detto ciò non usare il posizionamento assoluto, tieni presente che per IE il posizionamento assoluto significa far uscire gli elementi dalla clipview, ovvero ognuno per se.
Ti conveniva usare come si fa solitamente in questi casi un div unico contenitore di tutti gli altri div.
Tieni presente che puoi costruire il layout a strati sfruttando il fatto che i div sono elementi di blocco e quindi mandano a capo tutto ciò che li segue.
Usando un div contenitore con dentro uno che regge l'intestazione, uno il testo, uno il menù e uno il piè di pagina avresti un layout più solido anche in assenza di fogli di stile.