certe volte capita pure su siti come facebook che ti chiede di aprire una certa pag php...però mi sembra strano che lo faccia sempre e solo per i pdf come nel tuo caso!
Mi permetto di darti un suggerimento...Se devi solo caricare file sul server, mi spieghi perché usi il database? A che pro?
Guarda che ci sono funzioni php che ti permettono di scansionale una cartella e di farti vedere l'elenco di tutti i file...sarebbe più intelligente