E' semplice...
Crei un file tipo videos.php..
Codice PHP:
$name = $_GET['name'];
header("Location: [url]www.sito.it/video/miovideo-[/url]$name.flv"); 
E al posto di caricare il video da questo link:
www.sito.it/video/miovideo-cane_che_balla.flv
Lo carichi da questo:
www.sito.it/videos.php?name=cane_che_balla.flv
Così il "mal intenzionato" non saprà mai il vero percorso del video...