Un tempo Java era anche usato per operazioni di Awakening in remoto di server As/400 oltre che la loro gestione remota.
Al momento però non saprei dirti per questo speciale campo.

Per il resto ci sono delle applicazioni che per "sicurezza" di non avere gente che ti ruba il codice vengono scelte di esser fatte in Java, alcuni videogiochi Browser - Based, alcuni editor di Cms.

Ma temo siano solo una parte.

Lascio la parola ai programmatori del settore.