Ipotizziamo che entri nella linea 1, per estrarti tutti i prodotti della linea 1, e quindi tutte le categorie..puoi fare una cosa del genere.

Codice PHP:
SELECT categorie.nome_categoria FROM prodotti INNER JOIN categorie ON prodotti.id_categoria=categorie.id WHERE id_linea='1' GROUP BY id_categoria 
E con questo hai la lista delle categorie che contengono prodotti della linea 1