La cartella include dove si trova?
Con require("./include/footer.php") tu dici di includere il file presente nella sottocartella include contenuta nella stessa cartella dove si trova il file index.php.
Se la cartella include si trova in www.miosito.it/cartella/ mentre il secondo file index.php si trova nella sottocartella sub è normale che non funziona l'include perchè non trova il file.
Se vuoi includere il file anche in www.miosito.it/cartella/sub/index.php allora devi cambiare il percorso in ../include/footer.php

Quindi nel file www.miosito.it/cartella/sub/index.php metti:
Codice PHP:
require("../include/footer.php")