A parte il fatto che nn capisco perché usare entrambe le librerie, il problema è che usano tutti e due il dollaro come selector.
richiama jquery così:
codice:
<script src="mootools.js"></script>
<script src="jquery.js"></script>
<script>
    var $j = jQuery.noConflict();
</script>
da lì in avanti $j() sarà il selezionatore di jquery, e il $() quello di mootools.