Forse potrebbe tornarti utile la variabile innerHTML...
Assegni un id all'iframe, poi tramite il metodo getElementById() lo instanzi in un oggetto. A quel punto potrai assegnare un nuovo codice all'interno dell'iframe, direttamente inserendolo nello script...
Il problema è se devi usare linguaggi lato server nella pagina richiamata... sicuramente non è comodo, ma non saprei come altro fare