In realtà, anche se non ho messo un indirizzo assoluto, ma:/moduli/contatore.php il file contatore lo trova, ma non trova "contatore.txt", che è usato da "contatore.php".

Immagino che l'unica cosa da fare sia modificare "contatore.php", cosa che non volevo fare, non tanto per il contatore, ma per gli altri moduli che sono più complessi ed erano scritti per lavorare con i file nelle propria cartella, e non volevo neppure spostare tutto nella root del sito dove c'è già abbastanza casino!