Ti consiglio il redirect 301.
Con il modrewrite le pagine già indicizzate restano indicizzate perchè lo spider non riceve un responsecode 301 quando visita quelle url.
Anzi rischi che google rilevi i contenuti come duplicati e che escano dalla serp le pagine sbagliate.
Con il 301 i domini che redirigi dovrebbero uscire automaticamente dalla serp in breve tempo.