Se invece non vuoi passare ai div, un metodo per capire dov'è il problema può essere dare TEMPORANEAMENTE un colore di sfondo alle tabelle e alle celle.
In modo da capire qual è il punto in cui si sfasa.

es.
codice:
<table style="background-color:#f00">
la tabella interessata diventerà rossa e tu potrai vedere se è al posto giusto oppure se è sfasata... e così per tutti gli altri tag: table, tr, td, div

è un metodo un po' noioso, ma aiuta molto.