Utilizzavamo qualche tempo fa uno script simile sul nostro pannello di controllo proprio su spazio web aruba e la funzione unlink veniva eseguita correttamente... I file erano proprio in una sottocartella della public (l'unica che ha i permessi di scrittura su Aruba con hosting windows).

Credo che il problema sia quindi sullo script.
Se posti la porzione di codice si potrebbe verificare quella..