ci sono diversi modi... potresti:
- usare le sessioni
- usare creare una funzione facendo un require (su Luogo_nascita.php) della pagina che la contiene
- passarli tramite GET/POST
- rifare la query nella pagina Luogo_nascita.php

esempio:

pagina_principale.php
Codice PHP:
<?php 

function list_data(){

$ids = array();
$cognomi = array();
$nomi = array();
$classi = array();
$comuni = array();

$db = mysql_connect("localhost","root",""); 
mysql_select_db("Generale", $db); 
$result =mysql_query("SELECT * FROM studenti Where Classe=$Classe" ); 
while($myrow=mysql_fetch_array($result)){

$ids[] = $myrow['Id']; 
$cognomi[] = $myrow['Cognome'];
$nomi[] = $myrow['Nome'];
$classi[] = $myrow['Classe'];
$comuni[] = $myrow['Comune'];

}

return array("id" => $ids, "cognome" => $cognomi, "nome" => $nomi, "classe" => $classi, "comune" => $comuni);

}

function print_data($array){

$html = "";

for($i=0;$i<=count($array['id']);$i++){
$html .= "<tr> 
<td align= 'center'>$array['id'][$i]</td> 
<td align= 'center'>$array['cognome'][$i]</td>
<td align= 'center'>$array['nome'][$i]</td>
<td align= 'center'>$array['classe'][$i]</td>
<td align= 'center'>$array['comune'][$i]</td> 
</tr>"; 
}

return $html;
}

//utilizzo

$data = list_data();
echo print_data($data);

?>
Luogo_nascita.php
Codice PHP:
<?php 
require "pagina_principale.php";

$data = list_data();
$lista_comuni = $data['comune'];//array con i comuni

?>
come sempre scritto ma non controllato
ovviamente ci sono modo molto più semplici e sbrigativi, ma non ho ben capito se vuoi passare tutti i comuni nel link href che vai a creare o se ti servono solamente nell'altra pagina..