Premetto che non sono un'esperto.
Di solito alcuni tipi di virus si estendono a + Hard disk (te lo dico dato che mi è capitato tempo fa).Anche se personalmente uso AVG credo che nel tuo programma ci sia una voce sotto scansione che ti faccia scegliere che tipo di sezione vuoi scansionare...Poi se gli Hard Disk non li puoi + utilizzare la cosa + ovvia è riformattarli....