Guarda il codice non lo posto perché è abbastanza complesso.
Però una cosa volevo dirtela.
Io ho caricato l'applicazione con netbeans sperando che mi avesse aiutato nello sviluppo.

Però poi ho provato a lavorare sui files singolarmente con un semplice editor PHP e a uploadarli dalla pagina ftp del sito e i problemi non me li ha più dati.
Ora non so se ci sia un legame tra queste due cose, però siccome adesso pare che non mi da problemi faccio così senza usare netbeans