non ho capito come lo hai fatto partire prima

1. se lo fai a riga di comando piazzi la cartella della tua application dentro la webroot di apache e poi vai nella bin di apache e fai start

per cui riforzarlo significa stopparlo, eliminare la cartella e mettere la nuova, riavviarlo

i comandi di start e stop si trovano dentro la cartella bin sotto la home di tomcat